В этом отделе работают врачи-эпидемиологии, которые обобщая сведения, полученные при расследовании каждого случая заболевания, проводят анализ и выводы о том, как развивается эпидемия ВИЧ-инфекции среди населения Ростовской области, каковы ее масштабы, а также причины и условия распространения. На основании этих данных разрабатываются и осуществляются соответствующие профилактические и противоэпидемические мероприятия.